La productividad del mal ha caído en picado y, como consecuencia, Uka-Uka organiza una reunión de malvados: Dingodile, Tiny, N.Tropy, N.Gin y por supuesto, el Doctor Neo Cortex. Este último trabaja en un superbandicoot llamado Crunch, el cual necesita una cantidad desorbitante de energía que no le es posible suministrar, ya que los cristales son recuperados por Crash Bandicoot cuando el intenta conseguirlos. Para conseguir la energía, Uka-Uka libera a las cuatro máscaras elementales: unas máscaras con los poderes de los cuatro elementos (agua, tierra, aire y fuego) que fueron selladas por los antepasados ancestrales. Una vez libres se fusionan con Crunch, otorgándole sus poderes. Aku-Aku, al percatarse, alerta a Crash y a Coco, que parten en la sala de teletransporte construida por esta última, dispuestos a recorrer otra vez los mundos con el propósito de derrotar a sus nuevos enemigos y salvar por enesima vez al mundo.
Muy similar a los tres directamente anteriores, aunque con mejores gráficos, mayor intervención de Coco Bandicoot, ocho vehículos diferentes en varios niveles y el hecho de tener que enfrentarse al mismo jefe dotado de un poder elemental correspondiente a una de las máscaras anatgonistas. Sin embargo, al igual que en las anteriores aventuras se trata de cinco áreas con cinco niveles cada una en las que tendrás que encontrar el cristal de poder de cada nivel para enfrentarte al jefe de área y pasar a la siguiente. También puedes encontrar gemas y reliquias para desbloquear el vídeo final. Por el camino puedes recoger frutas wumpa, con 100 recibes una vida extra y máscaras Aku-Aku, las cuales te otorgan protección contra enemigos menores solo que cuando te enfrentas a Crunch, Aku-Aku desaparece.
